揭示太極圖結構的奧秘，那麼，太極圖的結構是怎樣的，它又有哪些奧秘呢？上面我們已經提到過，太極圖的結構是：外形是一圓圈，圓圈內有兩條陰陽魚；兩條陰陽魚呈首尾互抱的姿態，各佔一半空間，各畫著一個黑白不同的魚眼，這兩條魚又走成一個S曲線。可見，太極圖的結構極簡單，一筆可以畫成，然而其寓意極深，有些問題至今還是懸案，下面對其結構作簡要分析。
太極圖以圓為形，圓轉不息
太極圖以圓為形，通天人之際，盡宇宙之妙，反映了自然萬物存在和發展的普遍規律。
太極圖以圓圈為外形，從形式上看，圓形是簡單的、穩定的；從內容上看，圓的東西靈活，圓轉自如，它的內容是积極的、易變的，經常處於變化的狀態，這是太極圖圓形結構的本質，也反映了自然萬物存在和發展的普遍規律。可以說：日月運行、四時秩序、萬物繁衍不已，都在這個圓形所蘊含的高深玄妙的哲理之內。為什麼這樣講呢？
1、圓的運動是自然萬物普遍的運行形式。首先，從宏觀世界看，太陽、地球、月亮都是圓球體，並且都按照一個圓的軌跡運行，整個天體也都在轉動。
再從微觀世界看，一切物質的基礎都是由分子、原子構成的。而原子又由原子核和电子組成。通過放大兩百萬倍的儀器可以看出它們都呈圓球狀，而且电子也是在一個圓的軌跡上圍着原子核周而復始地運行。
在植物界中，樹木、花草、果實大都呈圓體。這同河裡的石頭一樣，是千百萬年來，為大自然的力量所造就、所篩選下來的。在這一淘汰的原則面前，順之者昌，逆之者亡。
在動物界中，也常能看到類似的情況般長壽的動物，都同圓有關係，如圓圓的龜類，席地而盤、曲線而行的蛇類，鹿在睡覺前，身子圈起來，把嘴巴抵在肛門上，表現出一種本能的、自我調養的方式。絕大多數動物冬眠時，將身體縮成一團，以降低能耗，減少代謝，這些姿勢都是受進化的規律制約而演化下來的。
在我們的現實生活中，由於圓能分散力的作用方向，人們根據此理去建造雙曲拱橋和隧道的拱頂；由於圓的物體阻力小，耐磨損，人們在汽車、武器等机械製造中多採用圓的零件；由於圓的表面積大、結構穩定，人們根據此理去建造館、塔、庭樓；圓的曲面可聚光、可成象、可反射，人們根據此理去創造太陽能爐、天文望遠鏡、雷達接受盤等。在家庭生活中，更比比皆是圓的器具。這一切，並不是人們特別嗜好圓，而是認識了規律，利用它為自己服務。
這一存在的規律，也必然地反映到人的思想意識領域，哲學家講，人類歷史是螺旋地發展的。而所謂螺旋不外是圓的組合。
2、圓的運動也是人體生命活動基本的運動形式。
我們知道，蛋白質是生命的物質基礎，而蛋白質肽鏈的基本構造就呈一雙螺旋狀態。從人的進化史來看，腦殼的形狀越來越圓，越來越大，人也越來越聰明。人在原始時期，手同腳一樣是長形的，隨着不斷的進化，手指越來越長，而且向外叉開，把手伸展后，便大致呈一個圓狀。正因為呈圓狀，所以才能握得牢，抓得穩，具有更多的功能。血液中的紅血球、白血球。正因為是圓形的，才能在血液中減少阻力，順利地進行組織滲透。人的這些重要器官的進化過程可以說都是一種圓的運動。
圓的運動能協調矛盾的差異，達到陰陽的平衡、虛與實、形與神、陰與陽偏差混亂就會導致死亡，協調平衡就利於生存，通過均勻、對稱、有規律、有節奏的圓形運動，能產生對大腦協調的剌激信號。而大腦又全面平衡身體內外的運動，使形體和精神得到“同一”，調整陰陽平衡，維護生命功能。
總之，太極圖圓的外形，給人們一種靈活的信息，初看它，它是靜態的，凝視它，就變成動態的》初看它，它是平面的，凝視它，就變為立體的。讀看百遍，千遍，就能自當曉悟，產生靈感。如果人們能精通太極圓形的哲理，將對易危為安，易亡為存，易禍為福，易亂為治;致心於玄境，致身於壽域大有補益。