中醫經典著作《黃帝內經》，受《易經》的影響很大。貫穿《黃帝內經》一書始終的陰陽學說，直接來自先成書的《易經》。陰陽學說是中國傳統文化的一種宇宙觀和方法論。《易經》八卦中的陰爻和陽爻，最早出現在我國夏朝的占書《連山》之中。古人以陰陽二氣為中心，從千變萬化紛繁複雜的事物中概括出八種基本物質形態，並以天、地、水、火、雷、風、山、澤命名，從而創造了八卦。八卦和64卦中幾乎都由陰爻和陽爻組成，體現了每一卦中陰陽的互依和互制，即使純陽乾卦也有純陰坤卦相配。《易經·繫辭傳》從哲學高度概括為“一陰一陽之謂道”。陽爻與陰爻乃矛盾對立之兩種符號，陽性與陰性乃矛盾對立之兩種事物。《黃帝內經素問·陰陽應象大論》曰“陰陽者，天地之道也，萬物之綱紀，變化之父母，生殺之本始，神明之府也”。可見陰陽學說是中醫理論的核心，源自《易經》無疑。《易經·繫辭》雲“乾道成男、坤道成女”，乾為父，坤為母，生震、良、坎、巽、離、兌六子，六子分男女，即天地萬物，這便是劃分事物和現象陰陽屬性的標準。事物和現象中對立着的陰陽兩方面是互相依存、互相為用的。《黃帝內經素問·陰陽應象大論》曰“陰在內，陽守之，陽在外，陰之使也。”正反映了《黃帝內經》對《易經》陰陽學說的發揮和應用。事物或現象中對立的陰陽兩方面是運動變化的，其運動的方式是彼此消長並在一定條件下向自己的反面轉化。《易經》在三組卦《泰》與《否》、《損》與《益》、《既濟》與《未濟》中體現的對立統一、互相轉化的觀點，被《黃帝內經》在解釋健康與疾病的關係和疾病轉歸時廣應用。可以說，正是在借鑒《易經》陰陽觀念的基礎上，中醫學的陰陽學說才得以進一步成。中醫陰陽學說的形成和發展，逐漸導致了經絡學說、臟腑學說、氣血津液等一系列中醫學理論的形成和發展。針灸子午流注即是根據《易經》與《黃帝內經》陰陽盛衰消長原理，認為經氣在人體中盛衰流注與晝夜日月運行相應，從而掌握經氣的周期性盛衰開合進行取穴，這也是《黃帝內經》生物鍾原理及干支紀時的發揮。中醫的藏象學說也源於《易經》，並在天象、物象和人象三結合中，進行發展。尤其在接受易理取類比象的基礎上，使法象有了新的突破，創立了頗具特色的中醫藏象學說。如《素問·陰陽應象大論》曰：“東方生風，風生木，木生酸，酸生肝，肝生筋，筋生心，肝主目。其在天為玄，在人為道，在地為化，化生五味。道生智，玄生神，神在天為風，在地為木，在體為筋，在藏為肝，在色為蒼，在音為角，在聲為呼，在變動為握，在竅為目，在味為酸，在志為怒，怒傷肝，悲勝怒；風傷筋，燥勝風，酸傷筋，辛勝酸”。正是把天象、地象、人象合三為一。雖然《易經》64卦中，在表面上呈現陽佔優勢或陰佔優勢，但總還是由陰與陽共同組成的，這種看法，非常接近現代科學的見解，因為這種思維方法，正是所謂“場”的思維方法。其實中醫的“氣”，以廣義氣本身就包括了“實體”和“場”兩方面。儘管陰陽學說不具備嚴格科學的表現形式，在大程度上帶有猜測和神秘的色彩，但作為中醫的指導思想，至今仍有深遠影響和指導意義。